Cette thèse se base sur différents éléments que le juge d’instruction Renaud Van Ruybeke a pu rassembler depuis le début de ses investigations et que les journalistes de Médiapart ont réussi à se procurer et, d’autre part, sur le travail personnel de ces mêmes journalistes.

Tout commence par le rapport « Nautilus », effectué par un ancien agent de la DST, Claude Thévenet, pour le compte de la DCN quelques mois après l’attentat de Karachi (lien). Celui-ci pose l’idée que l’attentat serait lié aux aspects financiers du contrat Agosta. Pour les amateurs de romans d’espionnages, le rapport indique aussi que des espions français du service action de la DGSE, auraient vengé la France en liquidant un officier pakistanais et en brisant les jambes de trois amiraux pakistanais (à lire l’article de libération).